Códigos em R para curvas de rarefação e extrapolação de diversidade de espécies
O capítulo “Rarefaction and extrapolation of species diversity during neotropical forest succession: an R routine using iNEXT package” do livro “Aplicações da Linguagem R em Análises de Vegetação”, que teve Écio Souza Diniz (Diretor da Beta Analítica) como organizador, oferece uma rotina de códigos em script para aprendizado e prática da estimativa de curvas de rarefação e extrapolação de diversidade de espécies usando o pacote iNEXT. O iNEXT ainda faz uso de funções base do pacote ggplot2 para gerar belos gráficos de dispersão para demonstração dessas curvas.
Os autores fazem uso de dados de floresta Amazônica para demonstrar a aplicação do iNEXT para analisar as diferenças em diversidade de espécies lenhosas entre quatroestágios sucessionais e a floresta sem perturbação (Old Growth Forest) usando abordagens de rarefação e extrapolação baseadas em indivíduos e cobertura baseadas em amostras.
Acesse o link para baixar o script com a rotina de códigos para geração de curvas de rarefação e extrapolação:
https://atenaeditora.com.br/catalogo/post/rarefaction-and-extrapolation-of-species-diversity-during-neotropical-forest-succession-an-r-routine-using-inext-package
Para baixar o livro completo acesse:
https://atenaeditora.com.br/catalogo/ebook/aplicacoes-da-linguagem-r-em-analises-de-vegetacao